免疫媽媽的免疫指數相當複雜，每一種抗體都有對應的指數。最常見的免疫問題包括紅斑性狼瘡及抗磷脂症候群，這些免疫問題通常會產生一些抗體，直接攻擊身體細胞或胚胎。
一名約30歲女性，因為流產三次，求診中國醫藥大學新竹附設醫院生殖醫學中心主任李孟儒，經抽血檢查，診斷該名女性為免疫媽媽，因為本身有免疫問題抗體攻擊胎兒，導致三次流產。當該名女性第四次懷孕後，醫師給予阿斯匹靈定期服用後，胎兒穩定成長，目前已經成功產下一名女寶寶。
李孟儒指出，免疫媽媽的抗體如果攻擊甲狀腺，因為甲狀腺素對胚胎發育很重要，甲狀腺素比較少，小朋友也會不容易發育；另外，如果攻擊血管內皮，就比較容易形成血栓，胚胎發育過程中的營養供應不好，小朋友也比較不容易長大。
臨床上會依媽媽的狀況給予免疫用藥，包括阿斯匹靈、奎寧或類固醇等口服藥物，控制免疫狀況；若仍無法自然懷孕，才可能需要進一步接受試管嬰兒。部分患者後續可能需要更強效的免疫抑制治療，例如免疫球蛋白或免疫抑制針劑，這部分則由風濕免疫科醫師評估。
李孟儒提醒，女性反覆流產超過2次或試管反覆失敗的情況，可能與免疫方面的問題有關，部分抗體可能會攻擊胚胎，增加流產的風險。流產後還要等身體恢復，才能準備下一次懷孕，整個過程曠日廢時，對媽媽的心理也會造成不小衝擊。